河姆渡遗址博物馆隶属余姚市文化和广电旅游体育局，于1993年5月对外开放。总占地面积52万平方米，分出土文物陈列馆、发掘现场展示区、原始生态园和田螺山遗址现场馆4大块。出土文物陈列馆是博物馆主体，展出文物精品337件，以环境、生产、生活、思想为主线内容，系统介绍河姆渡文化，展示7000年前祖先的生活，展览获浙江省2009年度“十大精品”荣誉，入围全国十大精品陈列评选；发掘现场展示区主要内容为重建考古发掘遗迹，复原干栏式建筑，再现原始生活场景，原始生态园复原依山傍水、沼泽湿地的先民生活环境，两地使人在身临其境时有所观，有所感，有所体验，有所领悟；田螺山遗址现场馆保留各个层面重要遗迹，实施边发掘、边展示模式，更感性地了解河姆渡文化和考古工作。

博物馆常年免费开放，年观众量50万余人次。开设稻谷脱壳、缝衣走秀、芦苇编织、模拟考古、钻木取火、搭建房屋、陶艺传承共7项远古文化体验活动，是宁波市中小学生社会实践大课堂A类资源基地。

河姆渡遗址博物馆为国家二级博物馆，坚持以“遗产保护、学术研究、开放接待、宣传教育”为主线，加强队伍建设和业务能力，先后获得国家文物局“优秀爱国主义教育基地”，中宣部“全国百个爱国主义教育示范基地”，人力资源和社会保障部、国家文物局“全国文物系统先进集体”等国家级荣誉。